Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsponQ3UPR9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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