Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrc4Q3UP24 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms