Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Washc4Q3UMB9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Washc4Q3UMB9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms