Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms