Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcgf5Q3UK78 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms