Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms