Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms