Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms