Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nom1Q3UFM5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nom1Q3UFM5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms