Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms