Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms