Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cops9Q3U898 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cops9Q3U898 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms