Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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