Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms