Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms