Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vars2Q3U2A8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms