Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms