Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Hbq1bQ3U0A6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Hbq1bQ3U0A6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Hbq1bQ3U0A6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Hbq1bQ3U0A6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Hbq1bQ3U0A6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hbq1bQ3U0A6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms