Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms