Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap5b1Q3TAP4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap5b1Q3TAP4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms