Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms