Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms