Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms