Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms