Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm1123Q1RME4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm1123Q1RME4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm1123Q1RME4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm1123Q1RME4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm1123Q1RME4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm1123Q1RME4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm1123Q1RME4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms