Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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