Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms