Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli2Q0VGT2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms