Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttc39dQ0VF76 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms