Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpne7Q0VE82 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne7Q0VE82 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms