Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb8Q0VBD0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms