Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrriq1Q0P5X1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrriq1Q0P5X1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms