Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps8Q0P5W1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms