Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms