Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ttc21bQ0HA38 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms