Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms