Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnma1Q08460 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnma1Q08460 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms