Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms