Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MestQ07646 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MestQ07646 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MestQ07646 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MestQ07646 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MestQ07646 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MestQ07646 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MestQ07646 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MestQ07646 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms