Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col17a1Q07563 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms