Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cntn3Q07409 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms