Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms