Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrstQ06666 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms