Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms