Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms