Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms