Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms