Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox10Q04888 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms