Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms