Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk16Q04735 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms